Pirmiausia pabrėžtina, kad tiekiamoms statybinėms medžiagoms atvirkštinis PVM netaikomas. Pavyzdžiui, kai statybinių medžiagų gamybos arba prekybos įmonė, prekiaujanti statybinėmis medžiagomis, parduoda (tiekia) šias prekes rangovui, kitam statybos darbus atliekančiam PVM mokėtojui arba pačiam statybos darbų užsakovui, ji pati turi apskaičiuoti ir paimti iš pirkėjo apskaičiuotą šių parduotų prekių pardavimo PVM ir PVM įstatymo nustatyta tvarka sumokėti jį į biudžetą.

Prieš įsigaliojant naujam atvirkštinio PVM apmokestinimo mechanizmui (iki 2015 m. liepos 1 d.), statybų įmonės turėjo mokėti. Dėl šios priežasties statybų bendrovės galėdavo susigrąžinti PVM skirtumą tarp šių dviejų PVM įmokų.

Įsigaliojus naujai tvarkai, statybos bendrovės nebemoka PVM už suteiktus statybos darbus, tačiau vis dar gali susigrąžinti PVM už įsigytas statybos prekes. Dėl šios priežasties biudžete liko daug grąžintinų PVM sumų, nors jį bendrovėms buvo galima susigrąžinti tik du kartus per metus.

Taigi nuo 2016 m. sausio 1 d. PVM skirtumą valstybė gali grąžinti kas mėnesį (vietoj pusmečio) įmonėms, parduodančioms statybos darbus, už kuriuos PVM turi apskaičiuoti pirkėjas. Pabrėžtina, kad toks grąžinimas galimas ir asmenims, parduodantiems metalą ar medieną, nes šioms prekėms taip pat taikomas atvirkštinis PVM.

Todėl PVM mokėtojams, pritaikiusiems atvirkštinio apmokestinimo PVM mechanizmą už nurodytas prekes ir paslaugas, kuriems mokestiniu laikotarpiu susidarė grąžintina PVM suma (PVM skirtumas), likusi po įskaitymo jos dalis, bet ne didesnė už sąlyginę 21 % sumą, apskaičiuotą nuo pirmiau nurodytų sandorių apmokestinamosios vertės, gali būti grąžinama per 30 dienų po prašymo grąžinti PVM permoką (skirtumą) gavimo dienos.